Historisch gezien leiden voedsel- en wateronzekerheid tot onrust, geweld
en oorlog in de wereld. Dat is een van de redenen waarom het Plant
Phenotyping and Imaging Research Centre (P2IRC) in Canada onderzoek doet
naar het verhogen van gewasopbrengsten en droogtetolerantie van planten.
Met andere woorden: hoe zorgen we ervoor dat de wereld geen honger meer kent?
Andere aanpak plantenonderzoek
Tot voor kort was onderzoek naar plantenveredeling gericht op de delen
van de plant die we boven de grond zien. Onderzoekers van het P2IRC
geloven juist dat het bestuderen van plantenwortels essentieel is om
voedseltekorten tegen te gaan. Een grote uitdaging van dit onderzoek zit
in het feit dat wortels onder de grond zitten en het belangrijk is om ze
in de natuurlijke omgeving te bekijken.
Om de wortels goed te bestuderen zonder de plant te storen, gebruikten
de onderzoekers daarom verschillende foto’s van het wortelsysteem in
de aarde en creëerden vervolgens een 3D-model van deze foto’s. Met
hulp van de computer werd de aarde eruit gefilterd zodat de wortels
helder te zien zijn.
Deze techniek zit vol uitdagingen, want er is veel
ruis te zien als je de afbeeldingen uit een heterogene omgeving zoals
grond haalt en speciale beeldbewerkingstechnieken verminderen ruis in
het beeld door gladde randen te creëren. Voor de wetenschappers is het
echter essentieel de randen helemaal juist worden weergegeven, want dit
is de wortelarchitectuur.
Versnelling door datacentertechnologie
De onderzoeksinstantie gebruikte desktopmachines om de afbeeldingen te
filteren en een duidelijkere afbeelding te krijgen, maar elke
filterronde zou maar liefst 48-72 uur duren. P2IRC besloot uiteindelijk
om hun HPC-infrastuctuur te upgraden naar Lenovo ThinkSystem SR650- en
SR850-servers.
De krachtige nieuwe servers hebben de manier waarop de
instantie het onderzoek doet aanzienlijk verbeterd – zowel qua tijd als
qua precisie. In plaats van 48-72 uur, duurt een filterronde nu nog maar
zes tot acht minuten. Bovendien hebben de wetenschappers tijd om dingen
aan te passen en te spelen met de parameters. Omdat het verwerken
vroeger dagen duurde, hadden de ze te weinig tijd om de afbeeldingen te
optimaliseren.
Cruciale bijdrage
Ik ben er trots op dat onze technologie in staat is om een cruciale
bijdrage te leveren aan het onderzoek dat honger moet
bestrijden door scherpere beelden te leveren en het onderzoeksteam van
meer precieze en zinvolle informatie te voorzien.
Tom Sluys, General Manager Datacenter Group Lenovo